- 1860–1861: Heinrich Ritter von Mertens, Bürgermeister der Stadt Salzburg
- 1861–1864: Dr. Franz Valentin Zillner, Arzt
- 1864–1874: Sanitätsrat Dr. Anton Sauter, Arzt und Botaniker
- 1874–1884: August Prinzinger senior, Advokat, Landtagsabgeordneter
- 1884–1887: Adolf Maximilian Ritter von Steinhauser, Jurist, Ehrenbürger der Stadt Salzburg
- 1887–1889: Franz Schweinbach, Beamter
- 1889–1916: Dr. h.c. Eberhard Fugger, Direktor des SMCA
- 1918–1918: Dr. August Prinzinger junior, Landeshauptmann-Stv., Jurist
- 1919–1920: Hofrat Eugen Pillwein, Verwaltungsbeamter
- 1921–1938: Hofrat Franz Martin, Landesarchivar
- 1938–1944: Dipl. Ing. Richard Schlegel, Landesplaner
- 1945–1945: Schulrat Dr. Karl Fiala
- 1945–1950: Franz Martin (nochmals)
- 1951–1972: Hofrat Dr. Herbert Klein, Landesarchivar
- 1973–1981: Univ.-Prof. Dr. Hans Wagner, Ordinarius für Geschichte
- 1982–1994: Hofrat Dr. Kurt Conrad, Direktor des Salzburger Freilichtmuseums
- 1994–1996: Hofrätin Dr. Friederike Zaisberger, Landesarchivarin
- 1996–2015: Univ.-Prof. Dr. Reinhard Rudolf Heinisch, Universitätsprofessor, Historiker
- 2015–2024: Dr. Thomas Mitterecker, Leiter des Archivs der Erzdiözese Salzburg
- seit November 2024: Mag. Markus Bürscher M.A.LIS, Archivar im Stift Seitenstetten
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